甘楊蘭教授

甘楊蘭，1984年生，教授。主要研究方向?yàn)闄C(jī)器學(xué)習(xí)與智能算法、生物信息學(xué)、大數(shù)據(jù)分析、網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。主持了國(guó)家級(jí)和省部級(jí)等各類科研項(xiàng)目10余項(xiàng)，包括3項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上2項(xiàng)、青年1項(xiàng)）、3項(xiàng)上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上2項(xiàng)、青年1項(xiàng)）、1項(xiàng)上海市“晨光計(jì)劃”人才項(xiàng)目和2項(xiàng)中央高校專項(xiàng)資金項(xiàng)目（重點(diǎn)1項(xiàng)、自由探索1項(xiàng)）等。已在研究領(lǐng)域的重要學(xué)術(shù)期刊和國(guó)際會(huì)議上發(fā)表高水平學(xué)術(shù)論文50余篇。2013年獲得上海市優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎(jiǎng)、2014年獲得上海市“晨光計(jì)劃”人才計(jì)劃獎(jiǎng)、2019年獲得教育部自然科學(xué)二等獎(jiǎng)。

研究方向：

1、 機(jī)器學(xué)習(xí)與智能算法

2、 生物信息學(xué)

3、 大數(shù)據(jù)分析

榮譽(yù)及獲獎(jiǎng)情況：

1、 上海市優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎(jiǎng)，上海市教育委員會(huì)，2013

2、 上海市“晨光計(jì)劃”人才計(jì)劃獎(jiǎng)，上海市教育委員會(huì)，2014

3、 教育部自然科學(xué)二等獎(jiǎng)，面向生物組學(xué)數(shù)據(jù)的計(jì)算預(yù)測(cè)方法，2019

4、 東華大學(xué)“師德建設(shè)青年標(biāo)兵”稱號(hào)，2019

5、 東華大學(xué)“三八”紅旗手稱號(hào)，2021

近年來(lái)承擔(dān)的主要科研項(xiàng)目：

1、 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上），基于腫瘤異質(zhì)性的致病通路發(fā)現(xiàn)及候選藥物組合預(yù)測(cè)，2022-01-01~2025-12-31，主持

2、 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上），基于單細(xì)胞多層次組學(xué)數(shù)據(jù)的腫瘤異質(zhì)性及其調(diào)控機(jī)制研究，2018-01-01~2021-12-31，主持

3、 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目（青年），基于數(shù)據(jù)挖掘的組蛋白修飾模式發(fā)現(xiàn)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能研究，2014-01-01~2016-12-31，主持

4、 上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上），基于異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤致病通路挖掘及候選藥物篩選算法研究，2021-07-01~2024-06-30，主持

5、 上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目（面上），融合多組學(xué)數(shù)據(jù)的腫瘤異質(zhì)性挖掘及調(diào)控機(jī)制研究，2017-05-01~2020-04-30，主持

6、 上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目（青年），基于生物信息計(jì)算的核小體定位模式及其功能研究，2013-10-01~2016-09-30，主持

7、 上海市“晨光計(jì)劃”人才項(xiàng)目，基于生物計(jì)算的組蛋白修飾模式及功能分析，2014-01-01~2016-12-31，主持

8、 中央高校專項(xiàng)資金（重點(diǎn)）項(xiàng)目，2016-1-1~2018-12-30，主持

9、 中央高校專項(xiàng)資金（自由探索）項(xiàng)目，2013-12-1~2015-12-30，主持

10、 上海市智能信息處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題，組蛋白修飾模式發(fā)現(xiàn)及功能預(yù)測(cè)研究，2012-12-31~2014-12-30，主持

近年來(lái)發(fā)表的代表性論著、專利：

1、 Yanglan Gan, Huichun Zhu, Wenjing Guo, Guangwei Xu, Guobing Zou*. Deep Semi-supervised Learning with Contrastive Learning and Partial Label Propagation for Image Data. Knowledge-Based Systems, 245: 1-11, 2022.

2、 Yanglan Gan, Xingyu Huang, Guobing Zou, Shuigeng Zhou, Jihong Guan*. Deep structural clustering for Single-cell RNA-seq data jointly through autoencoder and graph neural network. Briefings in Bioinformatics, bbac018: 1-13, 2022.

3、 Yanglan Gan, Cheng Guo, Wenjing Guo, Guangwei Xu, Guobing Zou*. Entropy-based inference of transitional states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics. Briefings in Bioinformatics, 23(4), bbac225: 1-12, 2022.

4、 Yanglan Gan, Ning Li, Cheng Guo, Guobing Zou, Jihong Guan*, Shuigeng Zhou*. TiC2D: trajectory inference from single-cell RNA-seq data based on consensus clustering. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 19(4): 2512-2522, 2022. 

5、 Yanglan Gan, Xin Hu, Guobing Zou, Cairong Yan, Guangwei Xu*. Inferring gene regulatory networks from single-cell transcriptomic data using bidirectional RNN. Frontiers in Oncology, 12: 1-10, 2022.

6、 Yanglan Gan, Yongchang Xin, Xin Hu, Guobing Zou*. Inferring gene regulatory network from single-cell transcriptomic data by integrating multiple prior networks. Computational Biology and Chemistry, 93: 1-8, 2021.

7、 Guobing Zou, Zhen Qin, Qiang He, Pengwei Wang, Bofeng Zhang, Yanglan Gan*. DeepWSC: Clustering Web Services via Integrating Service Composability into Deep Semantic Features. IEEE Transactions on Services Computing, 15(4): 1940-1953, 2022. (通信作者)

8、 Guobing Zou, Ya Liu, Zhen Qin, Jin Chen, Zhiwei Xu, Yanglan Gan*, Bofeng Zhang, Qiang He*. ST-EUA: Spatio-temporal Edge User Allocation with Task Decomposition. IEEE Transactions on Services Computing, DOI: 10.1109/TSC.2022.3144441, 2022. (通信作者)

9、 Guobing Zou, Jin Chen, Qiang He, Kuan-Ching Li, Bofeng Zhang, Yanglan Gan*. NDMF: Neighborhood-integrated Deep Matrix Factorization for Service QoS Prediction. IEEE Transactions on Network and Service Management, 17(4): 2717-2730, 2020. (通信作者)

10、 Guobing Zou, Tengfei Li, Ming Jiang, Shengxiang Hu, Chenhong Cao, Bofeng Zhang*, Yanglan Gan*, Yixin Chen. DeepTSQP: Temporal-aware Service QoS Prediction via Deep Neural Network and Feature Integration. Knowledge-Based Systems, 241: 1-12, 2022. (通信作者)

主要學(xué)術(shù)兼職：

1、 中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)-生物信息專委會(huì) 執(zhí)行委員

2、 中國(guó)人工智能學(xué)會(huì)-自然計(jì)算與數(shù)字智能城市專委會(huì) 委員

3、 上海市計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)-人工智能專委會(huì) 委員

4、 上海市計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)-生物信息專委會(huì) 委員

聯(lián)系電話：021-67792291                 E-MAIL：ylgan@dhu.edu.cn